Mortal Kombat, ünlü dövüş oyunu serisine dayanan bir aksiyon filmidir. Hikaye, MMA dövüşçüsü Cole Young'ın macerasıyla başlar. Cole, vücudundaki ejderha sembolünün ne anlama geldiğini keşfetmek için bir yolculuğa çıkar. Bu sembol, onu Mortal Kombat turnuvasına katılmaya seçilmiş bir savaşçı olarak işaret eder.
Cole, Sonya Blade ve Jax gibi diğer seçilmiş savaşçılarla tanışır. Birlikte, Dünya Diyarı'nı Dış Dünya'nın saldırılarından korumak amacıyla eğitim almaya başlarlar. Bu eğitim sürecinin liderliğini Raiden adlı gök tanrısı üstlenir.
Dış Dünya'nın karanlık büyücüsü Shang Tsung, turnuvayı beklemeden Dünya Diyarı'nın savaşçılarını ortadan kaldırmak için çeşitli planlar yapar. Sub-Zero, Mileena ve diğer kötü karakterler, Dünya Diyarı'nın savaşçılarını avlamak üzere görevlendirilir.
Film boyunca, karakterler kendi güçlerini keşfeder ve geliştirir. Cole, ailesini koruma içgüdüsünden ilham alarak kendi özel yeteneğini ortaya çıkarır.
Aksiyon sahneleri, oyunun ikonik Fatality hareketlerini içerir ve serinin hayranlarına tanıdık gelecek birçok referans sunar.
Karakterler, Dış Dünya'nın tehdidine karşı birleşirken, her birinin kişisel hikayeleri ve motivasyonları da derinlemesine işlenir. Scorpion ve Sub-Zero arasındaki tarihi düşmanlık, filmin yan hikayelerinden birini oluşturur.
Film, büyük final savaşıyla zirveye ulaşır. Dünya Diyarı'nın savaşçıları, Dış Dünya'nın güçleriyle yüzleşir ve turnuvanın kaderi burada belirlenir.
