Altı ay önce milyonlarca insanın gizemli bir şekilde kaybolduğu Rapture’da, yaşam yavaş yavaş normale dönmeye başlamışken, yeni bir tehlike belirmiştir. Bir uzman, yaşananların ardından daha büyük bir kaybolma dalgasının Rapture’a yaklaştığını iddia etmektedir. Ancak bu iddianın doğruluğuna pek inanmayan haber spikeri Cameron Buck, bu durumu araştırmak için harekete geçmiştir. Bu süreçte, kaybolma olayları sırasında eşini yitiren Ray adındaki bir adam, kızıyla annesi hakkında gerçeği gizlemeye çalışırken, Buck son derece korkutucu bir gerçekle yüzleşmek zorunda kalacaktır. Artık dünya, hiç olmadığı kadar büyük bir tehdit altındadır.
