Sondanın kurtarma sinyali Dünya'ya ulaştığında, ABD Uzay Kuvvetleri, Satürn'ün uydusu Pandora'ya bir kurtarma aracı göndermeye karar verir. Ancak, iniş yapmaya çalıştıklarında, Pandora'nın gelişmiş bir insansı türle dolu olduğunu keşfederler. Pandora Savaşı, bir grup bilim insanının uzak gezegen Pandora'ya seyahat etmesiyle başlar. Ryan ailesi gezegene ulaştıklarında, su altında daha büyük bir tehlikenin varlığını öğrenirler. Önceki bir görevden kurtulanları kurtardıktan sonra, ölümcül bir tehdidi geri getirebileceklerini bildikleri için, eve dönüş yollarını bulmaları gerekecektir. Cassini 3, Satürn'ün uydusu Pandora'ya iniş yapar ve hemen ardından Dünya ile olan bağlantısını kaybeder. Gemide Bulaşıcı Hastalık Uzmanı Dr. Jennifer Ryan ve eşi Dr. Cliff Ryan bulunmaktadır. Bu durum işleri daha da karmaşık hale getirir çünkü Cassini'nin kaptanı Jennifer ve Greg arasında geçmişte bir ilişki vardır.
