Batman ve Nightwing, bu sefer dünyayı kurtarmak için Poison Ivy ve Jason Woodrue ile karşı karşıya gelmek zorundadır. Bu ikili, gezegende yeni bir bitki-hibrit türü yaratma peşindedir. Ancak Batman, bu tehlikeli planın en küçük bir yanlış adımda bile tüm yaşamı tehdit edebileceğini fark etmiştir. Bu nedenle, istemeden de olsa, Joker'in eski sevgilisi Harley Quinn ile iş birliği yapma zorunluluğu doğar. Fakat Batman, Harley Quinn'e güvenmeyi asla düşünmemektedir. Yine de Harley, Batman'a yardım edeceğine ve Ivy'i dünyayı yok etmekten vazgeçirmeye dair söz vermiştir.
