Dört küçük kaplumbağa, radyasyona maruz kaldıklarında insan boyutlarına ulaşarak hayatları tamamen değişir. Bu dönüşüm sürecinin ardından, kaplumbağalar bir metropolün yer altındaki kanalizasyon sisteminde yaşamaya başlarlar. Burada, kendileri gibi farklılaşmış olan Splinter adında bir fare ile tanışırlar. Splinter, bu dört kaplumbağayı dövüş sanatları konusunda büyük bir ustalık ve özveri ile eğitmeye karar verir.
Splinter, kaplumbağalara isim verme görevini de üstlenir ve onlara Michelangelo, Raphael, Leonardo ve Donatello adlarını verir. Bu isimler, Splinter'ın hayranlık duyduğu Rönesans dönemi sanatçılarının adlarıdır. Splinter, kaplumbağaları yalnızca dövüş sanatlarında değil, aynı zamanda suçla mücadele konusunda da aktif birer savaşçı olmaları için yönlendirir.
Bir gün, başarılı ve çekici televizyon spikeri April, bu dört ninja kaplumbağanın varlığını keşfeder. April, kaplumbağaların güvenini kazanmayı başarır ve onlarla birlikte heyecan dolu bir maceraya atılır. Kaplumbağalar ve April'in ortak düşmanı, korkunç savaş lordu Shredder'dır. Shredder'ın kötü niyetli planlarını durdurmayı kendilerine görev edinen bu beşli, birlikte Shredder'a karşı durmaya karar verirler.
İyi seyirler dileriz.