30 yıl önce, uzaylılar dünyayla ilk temaslarını kurdular. İnsanlar, bu durumun ya bir saldırı ya da büyük bir teknolojik devrimle sonuçlanmasını bekliyorlardı. Ancak, beklenenin aksine, uzaylılar kendi gezegenlerinde hayatta kalan son bireyler olarak sığınmak için dünyamıza geldiler. Tüm dünya hükümetleri, bu yaratıklarla nasıl bir yol izleyeceklerini tartışırken, uzaylılar Güney Afrika'da District 9 olarak bilinen bir alana geçici olarak yerleştirildiler. Uzaylıların dünyada varlığına dair sabır artık tükenmek üzeredir. Uzaylılar üzerindeki kontrol, Multi-National United MNU adlı özel bir şirkete devredilmiştir. Bu şirket, uzaylıların silahlarını üretebilirlerse büyük kazançlar elde etme peşindedir. Ancak, MNU bu konuda başarısız kalmıştır çünkü silahların çalışması için gerekli olan şey uzaylı DNA'sıdır.
Bir MNU çalışanı olan Wikus van der Merwe, gizemli bir virüs kaparak DNA'sında değişiklikler yaşar. Bu durum, insanlar ve uzaylılar arasındaki gerilimi zirveye taşır. Aynı zamanda, Wikus, en çok aranan ve en değerli kişi haline gelir. Çünkü o, uzaylıların teknolojisini çözmenin anahtarıdır. Şimdi, Wikus'un kendini koruyabileceği tek yer, düşmanca bir ortamda District 9'dır.
